11月15日，在成都，顾品珍和赵又新联手发动兵变，逮捕了四川督军兼靖国滇军第一军军长罗佩金。随后他们打开了成都城门，川军开入成都。
11月17日，青年军第九师唐生智部开入贵州，贵阳督军刘显世宣布贵阳归附国民政府。
11月18日，云南督军唐继尧宣布下野，随后被南京方面委任为国民军事委员会委员，举家迁往武汉。
11月24日，南京政府主席黄兴签发民国五年第311号和312号主席令，任命张澜为四川省主席，李根源为云南省主席，刘显世为贵州省主席。同时命令以三年为限，先按地区全面戒烟。
11月25日，武汉国民政府军事委员会签发157号、158和159号委员长令。
157号令：将原属川军，滇军，黔军各部改编为国民青年军第十六师，第十七师，第十八师，第十九师，第二十师，第二十一师。分别任命：吕超、但怒刚，顾品珍，赵又新，王文华，袁祖铭六人出任师长；朱培德，朱建德（朱D），刘明昭（刘B承），俞培棣，杨希闵，范石生出任参谋长。
158号令：戴勘出任四川省军区司令，邓泰中出任四川安保总队司令，杨森任西康警备区司令；刘存厚出任云南省军区司令，王天培任云南安保总队司令，刘湘任云南安保边防总队司令； 金汉鼎出任贵州军区司令，罗佩金任贵州安保总队司令。
159号令：部队调防减员令，第一是从即日起，二十二个师除近卫师外，军官数量不变，士兵数量缩减到满编的60%。即每师总人数不超过一万五千人，大批被裁撤的士兵被分配的军备部的下属工厂或农场工作，其中的精锐转入安保部队继续服役。而对于军队驻地和新兵基地也做了如下调整：
第一师师长 李洪奎 参谋长： 夏威 部队驻防在武汉；新兵配属801基地，
第二师师长 鲁涤平 参谋长： 叶琪 部队驻防在安庆；新兵配属802基地
第三师师长 周正明 参谋长： 陶均 部队驻防在广州；新兵配属803基地
第四师师长 廖磊 参谋长： 胡宗铎 部队驻防在长沙；新兵配属804基地
第五师师长 俞作柏 参谋长： 晏道刚 部队驻防在南京；新兵配属805基地
第六师师长 戴岳 参谋长： 何成浚 部队驻防在成都；新兵配属806基地
第七师师长 李品仙 参谋长： 方本仁 部队驻防在贵阳；新兵配属807基地
第八师师长 陈浴新 参谋长： 邓玉麟 部队驻防在南宁；新兵配属808基地
第九师师长 唐生智 参谋长： 何应钦 部队驻防在常德；新兵配属809基地
第十师师长 刘震寰 参谋长： 谷正伦 部队驻防在杭州；新兵配属810基地
第十一师师长 张旭光 参谋长： 宋鹤庚 部队驻防在江夏；新兵配属811基地
第十二师师长 宋浩民 参谋长： 叶开鑫 部队驻防在赣州；新兵配属812基地
第十三师师长 欧阳武 参谋长： 张自忠 部队驻防在梧州；新兵配属813基地
第十四师师长 邓铿 参谋长： 王克文 部队驻防在昆明；新兵配属814基地
第十五师师长 唐海荣 参谋长： 贺云卿 部队驻防在福州；新兵配属815基地
第十六师师长 吕超 参谋长： 朱培德 部队驻防在九江；新兵配属816基地
第十七师师长 但怒刚 参谋长： 朱建德 部队驻防在衡阳；新兵配属817基地
第十八师师长 顾品珍 参谋长： 刘明昭 部队驻防在芜湖；新兵配属818基地
第十九师师长 赵又新 参谋长： 喻培棣 部队驻防在宜昌；新兵配属819基地
第二十师师长 王文华 参谋长： 杨希闵 部队驻防在泸阳；新兵配属820基地
第二十一师师长袁祖铭 参谋长： 范石生 部队驻防在襄阳；新兵配属821基地
近卫师师长 赵东生 参谋长： 黄绍竑 部队驻防在武汉。新兵配属101基地
至此国民政府基本上控制南方十二个省，而这一结果让南京方面很是吃惊，整个国民大会更是因此吵翻了天，不过最郁闷的还不是这些已经以国家主人自诩的国民代表们或者说议员们。而是以上海《申报》为媒体觉得丢分，郁闷，这段日子南京的民主气氛让他们觉得自己已经是无所不在的了。可是前几天四川还在川滇内战，一转眼的功夫就被国民政府一把抓了。甚至连预测的机会都没留给媒体，媒体们只能用“西南事变”的标题来表现这一次变化的突然性。随后，愤怒的记者们纷纷涌入南京国民政府和国社党党部所在地，要求政府给出真相，而对此国民政府的官员表示他们完全不知情，甚至他们比记者更需要真相。
国民政府的高层这一次确实是十分不满，因为这场被媒体称为西南事变的战争从头到尾都没有对南京方面做任何通报。这一点是他们无论如何都不能够接受的，虽然大家在国民政府组建之初曾许诺把军队交给王振宇领导的军事委员会，但是不代表王振宇就可以自由行动。在大家看来这种自由行动在打击敌人的同时也在打击政府的威信。
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